据英国媒体报道，约翰逊说，大部分感冒、咳嗽和流感都是由病毒引起的，不应该用主要用来抗菌的抗生素进行治疗。他说，英国国家医疗服务系统每年要为不必要使用的抗生素支付17亿英镑，因此他呼吁结束滥用青霉素等抗生素的做法。
滥用抗生素已经导致MRSA（耐甲氧西林金黄色葡萄球菌）这类抗药超级病菌的出现，并被认为是导致耐药型结核病感染增加的原因。滥用抗生素，尤其是患者不按完整疗程服用时，产生抗药性突变的细菌就会大量繁殖。
如果对抗生素的使用不加以控制，随着一些细菌的抗药性越来越强，医生们就会找不到有效的治疗手段。一些制药公司也不愿意投入大量资金用于研发新的抗生素，因为它们认为这不太赚钱。目前，最常用的抗生素阿莫西林的疗效已经不如以前，因为越来越多的细菌都对它产生了抗药性。
约翰逊宣布，英国从下个月起将实施一项耗资2.7亿英镑的针对超级病菌的防治计划。这项名为“清洁、安全护理”的计划将斥资4500万英镑，帮助医院增设负责感染监控的护士和抗生素专家药剂师等岗位。到2009年，所有进入英国医院看病者都要接受MRSA的筛查。
